Те са най-добре пазената тайна във Вселената. Служители на мощно финансирана, но неофициална правителствена агенция, Кей (Томи Лий Джоунс) и Джей (Уил Смит) са Мъжете в черно, извършващи имиграционни услуги и наблюдаващи всички извънземни на Земята. Кей и Джей се озовават насред ужасен заговор на междугалактически терорист, който е пристигнал на Земята с цел да убие двама посланици на различни галактики. За да предпазят света от сблъсъци, мъжете в черно трябва да заловят терориста и да върнат спокойствието на Земята. Това е един обичаен техен ден. Мъжете в черно са нашата най-добра, последна и единствена защитна линия, когато "близките срещи от трети вид" загрубеят. Работата им се пази в тайна и се обличат в черно.